גורמי מודיעין ישראליים בירושלים מסרו ביום ב' 27.6, כי משתתפי המשט לעזה מתכוננים למנוע בכוח מחיילי צה''ל להשתלט על ספינות המשט. גורמי המודיעין אמרו, כי יש בידיהם מידע לפיו חלק ממשתפי המשט התבטאו באחרונה כי הם מוכנים להרוג את חיילי צה''ל. פקידים בכירים בירושלים אמרו בלילה בתדרוך לכתבים כי מידע שהגיע לידיהם מצביע על אפשרות כי מארגני המשט מעלים לכ-10 הספינות העומדות להשתתף במשט חומרים כימיים, אותם הם יפעילו נגד חיילי צה"ל שינסו לעלות לסיפון. כמה גורמים מבין משתתפי המשט התבטאו בפומבי ב-24 השעות האחרונות כי הם לא יימנעו מעימות עם חיילי צה"ל.  

איראן המשיכה ביום ג' 28.6, לאיים ישירות על בסיסי ארצות הברית במזרח התיכון, ועל ישראל. לאחר הצגת שיגור של 14 טילים שהוגדרו 'ארוכי טווח', אמר מפקד כוחות הטילים של משמרות המהפכה האיראניים גנרל אמיר-עלי חאג'יזאדה, כי הטילים האיראנים יכולים לתקוף את בסיסי ארצות הברית באפגניסטן, וכל נקודה שהיא בישראל. איראן הודיעה כי  תשגר ביולי באמצעות הטיל קאוושגאר 5 לחלל קוף. אם אכן שיגור זה יבוצע, פירוש הדבר יהיה כי איראן הצליחה לפתח טיל המסוגל לשאת ולהכניס לחלל משקל של 330 ק''ג. זהו טיל המסוגל לשאת ראש חץ גרעיני לכל נקודה שהיא על פני כדור הארץ.