ניצב אמנון אלקלעי אמר בוועדת החקירה: "ביקשתי לסיים את תפקידי כי תהליך קבלת ההחלטות היה שגוי. המפכ"ל אמר לשרים: 'אם תהיה ועדת חקירה, תבואו אליי בטענות'". לדבריו, 11 יום לפני האסון אמר לשבתאי: "תתכוננו לאירוע רב נפגעים"

בעת חיפוש לילי בתא בחודש יולי, נתקע אחד האסירים במנהרה אך הסוהרים לא שמו לב להיעדרו. "היינו בטוחים שזה נגמר", סיפר אותו אסיר שסייע בחפירות. בנוסף, חומרי החקירה מגלים כי אסירים עברו תאים וכי טלפונים הוברחו מתחת לאפם של הסוהרים

באחד המקרים, עובד ב"מעלה הכרמל" נחקר בחשד שניצל מטופלת מינית בתמורה לתרופות, אך לא פוטר מעבודתו. מאבטח בבית החולים הורשע בעבירות מין בחוסה בת 13

ניצב שמעון לביא התייחס לחטיפת הצעירה ממקלט לנשים מוכות, ואמר "זה אירוע שגרתי אצלנו, אבל אם לא היינו מגיבים בזמן היא לא הייתה בחיים". השר בר לב: "האלימות לא צמחה יש מאין, זו תוצאה של הזנחה של מדינת ישראל"